Doanh nghiệp nhỏ và vừa đăng ký kinh doanh lần đầu được miễn thuế thu nhập doanh nghiệp trong 3 năm kể từ ngày cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp, áp dụng từ kỳ tính thuế 2025 theo Nghị định 20/2026/NĐ-CP.

Một công ty ở khu công nghiệp tỉnh Bắc Ninh. (Ảnh: CTV/Trí Thức VN)

Ngày 15/1, Chính phủ ban hành Nghị định 20/2026/NĐ-CP quy định chi tiết và hướng dẫn thi hành một số điều của Nghị quyết 198/2025/QH15. Nghị định hướng dẫn các chính sách miễn, giảm thuế thu nhập doanh nghiệp và thuế thu nhập cá nhân.

Theo nghị định, doanh nghiệp nhỏ và vừa đăng ký kinh doanh lần đầu được miễn thuế thu nhập doanh nghiệp trong 3 năm kể từ ngày được cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp lần đầu. Thời gian miễn thuế được tính liên tục từ năm đầu tiên được cấp giấy chứng nhận.

Trường hợp giấy chứng nhận được cấp trước ngày 17/5/2025 (ngày Nghị quyết 198/2025/QH15 có hiệu lực) mà còn thời gian ưu đãi thì doanh nghiệp được hưởng cho thời gian còn lại. Quy định này không áp dụng đối với doanh nghiệp thành lập mới do sáp nhập, hợp nhất, chia, tách, chuyển đổi chủ sở hữu hoặc loại hình doanh nghiệp.

Ưu đãi cũng không áp dụng nếu người đại diện theo pháp luật (trừ trường hợp không phải thành viên góp vốn), thành viên hợp danh hoặc người có số vốn góp cao nhất đã tham gia với vai trò tương tự trong doanh nghiệp đang hoạt động hoặc đã giải thể nhưng chưa đủ 12 tháng từ thời điểm giải thể đến thành lập mới.

Công ty quản lý quỹ đầu tư khởi nghiệp sáng tạo theo quy định của Luật Hỗ trợ doanh nghiệp nhỏ và vừa, doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo, tổ chức trung gian hỗ trợ khởi nghiệp đổi mới sáng tạo có thu nhập từ hoạt động khởi nghiệp sáng tạo, đổi mới sáng tạo theo quy định của Luật Khoa học, công nghệ và đổi mới sáng tạo được miễn thuế thu nhập doanh nghiệp trong thời hạn 2 năm và giảm 50% số thuế phải nộp trong 4 năm tiếp theo đối với thu nhập từ hoạt động này.

Thời gian miễn, giảm thuế được tính liên tục từ năm đầu tiên có thu nhập chịu thuế từ hoạt động khởi nghiệp sáng tạo, đổi mới sáng tạo.

Trường hợp không có thu nhập chịu thuế trong 3 năm đầu kể từ năm đầu tiên có doanh thu thì thời gian được tính từ năm thứ tư. Doanh nghiệp phải hạch toán riêng thu nhập được ưu đãi với thu nhập từ hoạt động sản xuất, kinh doanh khác. Nếu không hạch toán riêng được thì xác định theo tỷ lệ giữa doanh thu hoặc chi phí được trừ của hoạt động ưu đãi trên tổng doanh thu hoặc tổng chi phí trong kỳ.

Doanh nghiệp có thu nhập từ chuyển nhượng cổ phần, phần vốn góp, quyền góp vốn, quyền mua cổ phần, quyền mua phần vốn góp vào doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo được miễn thuế thu nhập doanh nghiệp đối với khoản thu nhập này.

Thu nhập từ chuyển nhượng bao gồm chuyển nhượng một phần hoặc toàn bộ cổ phần, phần vốn góp, quyền góp vốn, quyền mua cổ phần, quyền mua phần vốn góp vào doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo (bao gồm cả trường hợp bán doanh nghiệp), trừ thu nhập từ chuyển nhượng cổ phiếu, quyền mua cổ phiếu của công ty đại chúng, tổ chức niêm yết, đăng ký giao dịch theo quy định về chứng khoán.

Trường hợp bán toàn bộ công ty trách nhiệm hữu hạn một thành viên do tổ chức làm chủ sở hữu dưới hình thức chuyển nhượng vốn có gắn với bất động sản thì kê khai và nộp thuế theo hoạt động chuyển nhượng bất động sản.

Trong cùng thời gian, nếu doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo, công ty quản lý quỹ đầu tư khởi nghiệp sáng tạo, tổ chức trung gian hỗ trợ khởi nghiệp đổi mới sáng tạo, doanh nghiệp nhỏ và vừa có khoản thu nhập được hưởng miễn thuế, giảm thuế theo quy định vừa được hưởng miễn thuế, giảm thuế khác thì được lựa chọn hưởng chính sách có lợi nhất và thực hiện ổn định, không thay đổi trong thời gian miễn thuế, giảm thuế.

Trường hợp trong kỳ tính thuế đầu tiên mà thời gian hoạt động được miễn thuế, giảm thuế dưới 12 tháng thì doanh nghiệp được lựa chọn hưởng ngay từ kỳ tính thuế đầu tiên hoặc đăng ký với cơ quan thuế bắt đầu từ kỳ tính thuế tiếp theo.

Ngoài ra, theo nghị định, chuyên gia, nhà khoa học tại trung tâm nghiên cứu phát triển, startup, tổ chức trung gian hỗ trợ khởi nghiệp sáng tạo được miễn thuế thu nhập cá nhân trong 2 năm đầu, giảm 50% với 4 năm tiếp theo đối với khoản thu từ tiền lương, tiền công.

Doanh nghiệp được trích tối đa 20% thu nhập tính thuế thu nhập doanh nghiệp để lập Quỹ phát triển khoa học, công nghệ, đổi mới sáng tạo và chuyển đổi số. Doanh nghiệp sử dụng quỹ này để tự triển khai hoặc đặt hàng nghiên cứu phát triển khoa học công nghệ, đổi mới sáng tạo. Nhà nước cung cấp miễn phí các nền tảng số, phần mềm kế toán dùng chung cho doanh nghiệp nhỏ, siêu nhỏ, hộ kinh doanh và cá nhân kinh doanh.

Tính đến cuối năm 2025, Việt Nam có gần 1,1 triệu doanh nghiệp đang hoạt động.

Lan Anh